在冰河期海面较低而出现陆桥时，“古蒙古利亚人”（广泛分布于东南亚）之一部，从中国大陆南部移居到冲绳和西日本，形成了“原日本人”，他们便是绳纹时代日本人的母体。
自绳纹时代晚期开始，又有亚洲大陆移民进入日本，到弥生时代，大陆移民急剧增加。
经许多学者研究，认为弥生时代的大陆移民，来自朝鲜半岛和中国东北，蒙古东西伯利亚等东北亚地区，属“新蒙古利亚人”系统，最初居住于本州西端和北九州，以后逐渐向东扩散，经近畿地区扩散至关东地区。
在这个时代，有许多中国江南地区的移民，直接或经南岛地区进入日本。
在扩散过程中，他们不断与原居民混血。
弥生时代后的古坟时代（3世纪至6世纪），大陆移民仍不断进入口本，且继续向东日本扣各地扩散，与原居民的混血亦持续进行。
也就是在这一时期，秦始皇派徐福率三千童男童女东渡日本，并留在了那里，为日全人留下了种。
当时的日本，弹丸之地，却有上百国之多，如果放在中国，那些个所谓的国家，也就是一群土地主而已。
中国正史《汉书·地理志》记载说：“乐浪海中有倭人，分为百余国，以岁时来献见云。”
其中的“百余国”，虽非确数，但也反映了公元前2世纪至公元1世纪这一时期，在日本列岛小国林立的状况。
